Готовые решения для онкологических исследований
| МЕТОД ДЕТЕКЦИИ: | ПЦР в реальном времени | Капиллярный электрофорез | Полупроводниковое секвенирование |
|---|---|---|---|
| КОЛИЧЕСТВО ТЕСТОВ (ВЫЯВЛЯЕМЫХ МУТАЦИЙ) | BRAF-KRAS панель: 1 ключевая мутация (V600E) гена BRAF (1 мутация и 1 дикий тип) 14 мутаций гена KRAS (14 мутаций и 14 диких типов) EGFR панель: (30 мутаций и 10 диких типов) Примечание: к концу 2012 года планируется создание наборов реагентов для 250 генов. | Панель: 12 мутаций гена KRAS (6 мутаций в 12 кодоне и 6 мутаций в 13 кодоне) Панель: 3 мутации гена BRAF | Онкологическая панель: области «горячих точек» -мутации 46 онкогенов и онкосупрессоров, с полноэкзонным покрытием генов KRAS, BRAF, EGFR. Расширенная онкологическая панель: все экзоны 400 онкогенов и онкосупрессоров Панель на заказ. |
| ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ МЕТОДА | Возможность обнаружения менее 0,1% мутантных молекул в геномной ДНК дикого типа. (1-5 мутантных молекул в 1 миллионе копий молекул дикого типа) Для анализа достаточно 100 нг ДНК | Возможность обнаружения 3-5 % мутантных генов в геномной ДНК дикого типа Для анализа достаточно 10 нг ДНК | Возможность обнаружения 0,01 % мутантных генов в геномной ДНК дикого типа Для анализа достаточно 10 нг ДНК |
| ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТЬ (КОЛИЧЕСТВО ОБРАЗЦОВ ЗА ОДИН ЗАПУСК ПРИБОРА) | Зависит от формата термоблока на приборе: 96-ти, 384-ех луночные планшеты; микропроточные карты и Open Array-слайды | Зависит от количества капилляров на приборе: 3500 - 8 капилляров 3500xl - 24 капилляра 3730 – 48 капилляров 3730xl - 96 капилляров | Зависит от типа полупроводни-кового сенсорного микрочипа: PGM: 314 микрочип – 1,2 млн. сенсоров (более 10 млн. пар оснований за запуск) 316 микрочип – 6,3 млн. сенсоров (более 100 млн. пар оснований за запуск) 318 микрочип – 12 млн. сенсоров (более 10 мрд. пар оснований за запуск) Ion Proton: Ion Proton™ I чип - 165 млн. сенсоров (2 экзома человека) Ion Proton™ II чип – 660 млн. сенсоров (1 геном человека) |
| ВРЕМЯ БЕЗ УЧЁТА ПРОБОПОДГОТОВКИ | 30 минут - 2 часа (быстрый или стандартный режимы) | около 2-х часов | около 8 часов |
| ПРЕИМУЩЕСТВА |
|
|
|
| НЕДОСТАТКИ |
|
|
|